Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций




НазваниеВидовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций
Дата конвертации13.03.2013
Размер445 b.
ТипПрезентации


 

  •  

  • Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной РНК, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций

  •  

  •  

  • Выполнила: Савельева Ксения,

  • ученица 11 специализированного класса

  • МБОУ Краснообской СОШ № 1

  • Научный руководитель:

  • канд. биол. наук Афонюшкин Василий Николаевич


Задачи:

  • Задачи:

  • 1. Освоить метод электрофореза ДНК в геле агарозы 2. Освоить метод анализа результатов секвенирования и провести построение нуклеотидных последовательностей фрагментов гена 16 S рибосомальной РНК полученных изолятов рода Bacillus

  • 3. Изучить перспективы совместного использования методов секвенирования и биохимической идентификации бактерий



Чистые культуры изолятов высевали на МПА и после 16-24 часов инкубации готовили бактериальную взвесь на фосфатно-солевом буфере. Культуры окрашивали по Грамму и микроскопировали.

  • Чистые культуры изолятов высевали на МПА и после 16-24 часов инкубации готовили бактериальную взвесь на фосфатно-солевом буфере. Культуры окрашивали по Грамму и микроскопировали.

  • Оценивали следующие биохимические свойства:

  • Утилизация цитрата, малоната, глюкозы, лактозы, маннита, сахарозы, инозита, сорбита, арабинозы, мальтозы, фенилаланина, образование индола, сероводорода, ацетилметилкарабинола (Реакция Фогес-Проскауэра), наличие бета-галактозидазы, уреазы, декарбоксилаз аргинина и лизина, гидролазы аргинина.

  • Культуры тестировали на каталазную, цитохромоксидазную активности, образование нитритов, синтез пигментов, антибиотикорезистентность, изучали культуральные и морфологические свойства. Бетта-галактозидазную, тритофандезаминазную и глюкоронидазную активности проверяли на среде Уриселект 4 (BioRad).ДНК выделяли фенолхлороформенным методом, вид определяли на основе секвенирования фрагмента гена 16S рибосомальной РНКи межгенного спейсера 16-23S рибосомальной РНК и совокупности биохимических, культурных и морфологических признаков.

















Видовая идентификация микроорганизмов на основе секвенирования может являться «золотым стандартом» лабораторной диагностики, однако точность метода ограничена достоверностью и полнотой баз данных GenBank и, следовательно, требует дополнительного использования подтверждающих тестов.

  • Видовая идентификация микроорганизмов на основе секвенирования может являться «золотым стандартом» лабораторной диагностики, однако точность метода ограничена достоверностью и полнотой баз данных GenBank и, следовательно, требует дополнительного использования подтверждающих тестов.





Похожие:

Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconСравнительная геномика и метаболическая реконструкция бактериальных патогенов Михаил Гельфанд
Идентификация пробелов в метаболическом пути (универсальные, таксон-специфические, в отдельных геномах)
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconЦель: изучить строение бактериальной клетки; формы бактерий; способы питания бактерий; размножение бактерий
Сосредоточить внимание учащихся на особенностях строение и жизнедеятельности бактерий
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconВ. М. Кузнецов, Г. А. Шехтман (Геофизические Системы Данных) V. M. Kuznetsov, G. A. Shekhtman gds
«Роль и место метода всп в количественной интерпретации данных современной сейсморазведки.»
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций icon1. История изучения бактерий История изучения бактерий
Слоистые каменные структуры строматолиты, датируемые в ряде случаев началом археозоя (архея), т е возникшие 3,5 млрд лет назад, результат...
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconНуклеиновые кислоты 9 класс Открытие нк
Рнк это самые маленькие по размерам рнк. Они связывают ак и транспортируют их к месту синтеза белка
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconТранскриптомика – идентификация всех матричных рнк, кодирующих белки, определение количества каждой индивидуальной мрнк, определение закономерностей экспрессии всех генов, кодирующих белки. Транскриптомика
Рнк, кодирующих белки, определение количества каждой индивидуальной мрнк, определение закономерностей экспрессии всех генов, кодирующих...
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconНевидимая опасность Состав проектной группы
Мы провели исследование количества бактерий и грибов в нашей гимназии, а также влияния количества бактерий на здоровье учеников
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconЦель: Знакомство учащихся с методом математического моделирования, демонстрация применения метода математического моделирования для решения экологических задач,
Дальтон задание 7 класс Тема: «Сохранение природных ресурсов планеты» ( через практическую работу по энергосбережению в доме)
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconГепатит а гепатит а вирус гепатита а (вга, hav)
На рибосомах происходит трансляция вирусного генома и образование полипептида-предшественника, который нарезается на вирусные белки...
Видовая идентификация бактерий методом секвенирования гена 16S рибосомальной рнк, роль и место метода в диагностике бактериальных инфекций iconВозможности ультразвукового исследования в диагностике эндофитного рака желудка
Среди всех онкологических заболеваний частота заболеваемости раком желудка по-прежнему высока и составляет около 9% среди всех онкологических...
Разместите кнопку на своём сайте:
hnu.docdat.com


База данных защищена авторским правом ©hnu.docdat.com 2012
обратиться к администрации
hnu.docdat.com
Главная страница