Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах




НазваниеПрезентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах
Дата конвертации31.01.2013
Размер481 b.
ТипПрезентация


предидущая презентация


Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах

  • Тарту

  • 2008



Содержание

  • Геномы и их размеры. Секвенирование. Библиотеки ДНК. Секвенирование генома человека.



Размеры геномов

  • Homo sapiens 22 хромосомы + X и Y

  • 3000МВр или 3×109 пар оснований

  • Мышь (Mus musculus) 2500МВр

  • (Danio rerio) 1700MBp

  • Дрозофила (Drozophilla melanogaster) 122MBp

  • C.elegans 100MBp

  • Пекарские дрожжи (S.cerevisiae)12,5МВр

  • Кишечная палочка (E.coli) 4,7MBp



Amyda cartilaginea Трионикс чернолучевой

  • ~4500MBp

  • Отсутствие строгого соотношения между размером генома и сложностью организма называется C-paradox



Секвенирование

  • Определение последовательности нуклеотидов в цепочке ДНК

  • Секвенирование ДНК по Максаму и Гилберту: метод химической деградации (1977)

  • Секвенирование ДНК по Сэнгеру: метод "терминаторов" (1977)



Фредерик Сэнгер (Frederick Sanger)

  • Род. 1918 в Англии

  • Учился и работал в Кэмбридже

  • Первая нобелевская по химии (1958) «За установление структур белков, особенно инсулина»

  • Вторая нобелевская по химии (1980) «За фундаментальные исследования биохимических свойств нуклеиновых кислот, в особенности рекомбинантных ДНК»

  • Женат, трое детей

  • На пенсии с 1983 года



Mетод Сэнгера





Секвенаторы

  • Автоматизируют только детекцию

  • Бывают капиллярными и гелевыми

  • Терминатор -нуклеотиды соединены с флуорофорами



Секвенаторы



Флуорофоры



Альтернативы

  • На самом деле есть еще новые, альтернативные методы секвенирования ДНК

  • Пиросеквенирование (pyrosequencing), 454 Life Science

  • Чип секвенирование

  • Nanopore sequencing



Библиотеки ДНК (DNA libraries)

  • Популяция идентичных векторов, каждый из которых содержит разные фрагменты одного генома.



Библиотеки кДНК (сDNA libraries)

  • кДНК – комплементарная ДНК

  • Библиотека кодирующего генома

  • Отсутствуют некодирующие регионы ДНК







Human Genome Project

  • Начался в 1990 году и закончился 2003

  • Участники: США, Китай, Франция, Германия, Япония и Великобритания

  • Цели:

  • Определение нуклеотидной последовательности генома человека

  • Картографирование и определение всех генов человека

  • Сохранение этой информации в банках данных

  • Улучшение техник секвенирования

  • Развитие техник обработки данных

  • На протяжении проекта ответить на появившиеся правовые, социальные и этические вопросы



Human Genome Project

  • Начался в 1990

  • До 1998 года эффективность была очень маленькой



Стратегия HGP: Clone by clone

  • Нуждается в физическом картографировании клонов исследуемого генома

  • Требует большого объема времени и труда



Celera Genomics

  • Секвенирование Haemophilus influenzae (1.83Mbp) используя новую стратегию (1995)

  • Celera была основана 1998 году Крэйгом Вентером (Craig G. Venter)

  • Celera была создана с целью производства и продажи генетической информации для более быстрого понимания биологических процессов



Стратегия Celera Genomics: Whole genome shotgun

  • Никакого картографирования

  • Секвенируем все подряд и потом собираем эту мозаику.



Результаты

  • В 2000 году обе организации представили черновые варианты

  • В 2003 году оба конкурента добрались до финиша практически одновременно

  • Чем черновик отличается от конечного варианта: каждый участок ДНК секвенируется 5 раз. Для конечного же варианта надо 10 раз. В таком случае данные являются верными на 99,9%. Вероятность ошибки равна 1 на 10000 нуклеотидов.



Результаты

  • Геном человека просеквенирован на 92%.

  • Заполнения пустот, неизбежных при любой из двух стратегий, происходит до сих пор.



Похожие:

Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация выполнена учителем биологии Презентация выполнена учителем биологии моу сош №1 р п. Лысые Горы Саратовской области Жарковой В. П
Народное название боярка, барыня. Относится к семейству розоцветных. Плоды издавна используются в питании, лечении
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация подготовлена учителем биологии Презентация подготовлена учителем биологии моу сош №1 р п. Лысые Горы Саратовской области Жарковой В. П
Лесной красавицей называют черёмуху, когда она в конце мая одевается в чарующий белоснежный наряд
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconБиотехнологии Биотехнологии
«Компания может до 50% патентов и инновационных решений получать из внешней научной среды. Поэтому формат R&D (reaserch and development)...
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация к уроку биологии на тему: Общая характеристика грибов, их строение, жизнедеятельность
Из опыта использования элементов инновационных технологий и компьютерных презентаций для активизации учебно познавательной деятельности...
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация проекта Уткина А. В., учителя химии и биологии моу «Новосергиевская средняя общеобразовательная школа №3»
...
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация по биологии На тему: Кашалот Подготовил: студент Эип-д-1, Болдырев Василий
Российский Государственный Социальный Университет Факультет Охраны труда и Окружающей среды Кафедра социальной экологии Презентация...
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconИспользованием мутаций, т е. селекцией, люди начали заниматься задолго до Дарвина и Менделя
Были разработаны методы генной инженерии отрасли молекулярной биологии конструирование in vitro (вне живого организма) новых функционально...
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconЕ. В. Тебенькова Татьяна Михайловна учитель химии и биологии школы 255 кандидат биологических наук почетный работник образования РФ © 2007 Цели и задачи Презентация
Презентация предназначена для дополнительного образования учащихся восьмых девятых классов
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация по географии Выполнила ученица 7 класса а полякова Елизавета
Вы получите массу незабываемых и ярких впечатлений ! Сейчас мы расскажем немного об Австралии!
Презентация Немного о биотехнологии, молекулярной биологии и геномах iconПрезентация представляет собой информационно-демонстрационный материал к уроку биологии для учащихся 5 класса
Данная презентация представляет собой информационно-демонстрационный материал к уроку биологии для учащихся 5 класса
Разместите кнопку на своём сайте:
hnu.docdat.com


База данных защищена авторским правом ©hnu.docdat.com 2012
обратиться к администрации
hnu.docdat.com
Главная страница